A avaliação dos alunos no CEEBJA – Toledo acontece de forma diagnóstica, contínua, sistemática, abrangente e permanente. Os instrumentos de avaliação são: trabalhos, avaliação escrita, prova prática nas disciplinas que a exijam, avaliação oral e inclusiva.
A avaliação é realizada no processo ensino-aprendizagem sendo os resultados expressos numa escala de 0 a 10,0; que deverá constar de trabalhos com valor 3,0 e avaliações com valor 7,0 em cada disciplina na organização coletiva e na organização individual. A recuperação de estudos se dará paralela e concomitantemente ao processo ensino-aprendizagem no sistema coletivo, considerando a apropriação dos conhecimentos básicos; no sistema individual, a recuperação se dá de forma contínua contando o tempo que o aluno precisar para dar conta dos conteúdos básicos trabalhados (leva-se em conta o tempo e o ritmo do aluno).